O torneio de judô nas Olimpíadas Escolares 2009 – 15 a 17 anos – tem disputas individuais no feminino e no masculino em oito categorias: superligeiro, ligeiro, meio-leve, leve, meio-médio, médio, meio-pesado e pesado. Cada unidade federativa pode inscrever um atleta por categoria de peso e sexo. O tempo de luta será de quatro minutos nos dois sexos. As categorias com seis ou mais participantes são disputadas no sistema eliminatório de repescagem olímpica, que premia um primeiro, um segundo e dois terceiros colocados. Nas categorias com três a cinco atletas inscritos, o sistema adotado é o de rodízio (todos contra todos), premiando um primeiro, um segundo e um terceiro colocado. No confronto com somente dois participantes, o sistema é o melhor de três confrontos. Não há graduação mínima exigida.
